柱岛海军军港。它位于著名的广岛市—南面和不大出名的海滨城市岩国东南。位临濑户内海。
横须贺海军军港。位于日本本州岛东京湾人口处东岸的横须贺港，北有横滨市相连，南和横须贺市东岸接壤，是日本的“帝国海军之都”。二战时是日本四大海军军港之一。
神户海军军港，位于本洲东南部，兵库县首府神户市。（海军造船厂——川崎）
吴海军军港，吴军港位于日本广岛县，位临濑户内海，二战时是日本四大海军军港之一。（日本最大的海军工厂——吴海军工厂）
佐世保海军军港，位于日本九州岛西北岸的佐世保港，属长崎县，四周被山环绕，进口航道的西面又有五岛列岛作为屏障，是一个天然良港。它北靠佐世保市，由九州岛的西彼杌半岛和针尾岛围成，呈一个不规则的“Y”型。二战时是日本四大海军军港之一。
长崎海军军港，位于日本九州长崎市，属于长崎县，是日本西南联合舰队的母港。（海军造船厂——三菱重工）
冲绳白滩海军军港，位于胜连半岛的东南岸，现在是美军驻日本的海军基地。
那霸海军军港，位于冲绳岛的西南岸，面临东海那霸湾，是日本冲绳乃至琉球群岛中最大的城市、港口和海军基地。现在是美军驻日本的海军基地。
舞鹤海军军港，位于日本本州中西部日本海沿岸重要港市——舞鹤市。属京都府。临若狭湾西部舞鹤湾。
函馆海军军港，位于日本北海道函馆市，是新兴的海军军港。
